В далеком 1936 году в городе Ойрот-Тура, центре автономной области, было построено, по одному из лучших  в то время проектов, здание школы №12, и 1 сентября  новая школа-десятилетка гостеприимно распахнула двери для своих учеников. Их ждали десять просторных  светлых классов, спортивный зал, библиотека, новенькие парты и опытные учителя.  В то время  микрорайон школы был центром города, а сама школа - первой средней.

Первым директором был назначен  Михаил Осипович Иванов, который преподавал историю. Учителем литературы работал Иван Яковлевич Красновский, а его жена, Анна Васильевна, была учителем начальных классов; биологию преподавала  Лидия Петровна Бобрикова, немецкий язык – Наталья Федоровна Петрова, математику – Варвара Ефремовна Сыроежкина, химию – Сергей Иустинович Пагур. В начальных классах работала  Екатерина Ивановна Плюхина, впоследствии за добросовестный и многолетний труд она была награждена Орденом Ленина и Орденом Трудового Красного знамени, а также медалью «За трудовую доблесть».

В 1937 году директором школы стал  Александр Константинович Алексеев. Молодой, энергичный, требовательный  педагог, он пользовался безграничным авторитетом среди  учителей  и учеников. Когда началась война, он вместе с выпускниками школы ушел на фронт и погиб.

Первый выпуск состоялся в1938 году, аттестаты зрелости получили 32 человека.

В годы войны руководил школой Евгений Григорьевич Надеждин. После перевода из 10 школы в 1941 году учителем начальных классов работала  Екатерина  Ивановна Истегешева, которая впоследствии за многолетний и добросовестный труд  была награждена Орденом Ленина.     

Биография  школы этого времени тесно связана с далекой Москвой, Одессой, Ленинградом, так как эвакуированные оттуда учителя: И.И.Маляревский, А.С. и Е.Л. Певзнер,  из Москвы – Ю.Б.Васильев, Л.Р.Кабо, из Одессы – Р.М. Шарф, и дети обрели здесь свой дом. Многие выпускники  любовь и нежность к  ставшему  родным  городу выражали в стихах. Одно из них впервые  было  опубликовано к 40-летию Победы в газете «Звезда Алтая» по просьбе Любови Рафаиловны Кабо. Его автором является вывезенный из блокадного Ленинграда бывший ученик школы №12  Боря Перепечко:

Пусть пройдут десятилетия,

Но мы и сегодня уверены-

Не уйдет из нашей памяти

Та суровая пора.

Укрывал нас в дни военные

Средь Алтайских гор затерянный

Тих ий, добрый и приветливый

Городок Ойрот-Тура.

Многое пришлось пережить всему школьному коллективу в годы Великой Отечественной войны. Было холодно, не хватало топлива, и дрова надо было заготавливать самим.

В послевоенные годы трудились в школе ветераны Великой Отечественной войны Л.Б. Гринев, А.И. Артюшенко, И.И. Басманов, В.Г. Иванников. Мирная жизнь налаживалась: в школе стали  проводить предметные олимпиады под руководством Абрама Самуиловича Певзнер, начал работать драматический кружок, руководила которым Евдокия Ивановна Фролова, издавалась школьная газета под руководством Злобиной Лидии Степановны. В эти же годы  появилась в школе производственная бригада, а в 1957 году под руководством А.Т. Ждановой был заложен школьный фруктово-ягодный сад. Вместе со своими воспитанниками Анна Тимофеевна приняла участие во Всероссийском конкурсе по проведению Дня защиты природы, где они получили 3-ю Всероссийскую премию.

В 60-70-ые годы, когда директором был Константин Иванович Тишков,  школа переходит на одиннадцатилетнее  политехническое обучение. Выпускники вместе с аттестатом зрелости получали квалификационные свидетельства связистов, электриков, швей. С благодарностью вспоминают ученики своих учителей: Тадыш Любовь Ивановну, Злобину Лидию Степановну, Кропочеву Алевтину Михайловну, Леонтьеву Татьяну Агаповну, Станову Клавдию Павловну, Соколову Зою Александровну, Кудрявцеву Марию Константиновну.

Шли годы, назрел вопрос о расширении школы, так как количество учеников в два раза превышало количество мест, поэтому заниматься приходилось в три смены.  И в 1961 году была введена в эксплуатацию пристройка на шесть классных комнат. В 1962 году была оборудована мастерская по обработке дерева и металла. В 1967 году под руководством Ильи Ильича Басманова в школе проведена реконструкция: печное отопление заменено водяным.

В конце 70-х годов директором стал молодой, перспективный педагог, Юрий Александрович Шевченко. Именно под его руководством было организовано благоустройство здания и территории школы (разбит цветник, обновлено оформление кабинетов), активизировалась работа органов ученического самоуправления (Учкома, комитета комсомола, Совета пионерской организации).

В 80-ые годы школой руководила Людмила Дмитриевна Степанова,  в то время большое внимание уделялось трудовому воспитанию. На протяжении многих лет при ОПХ Горно-Алтайское НИИ садоводства Сибири работал лагерь труда и отдыха. Под руководством учителей  учащиеся собирали  урожай плодов и ягод, пололи посадки саженцев, вели опытническую работу.

Первыми помощниками директора во всех её начинаниях были завучи - Горбунова Татьяна Петровна и Калашникова Мария Ивановна, военный руководитель – Трутнев Виктор Корнеевич.  В эти годы плодотворно трудились Илясова Раиса Ильинична, Сараева Серафима Тимофеевна, Якимова Тамара Ивановна, Шадрина Надежда Евграфовна, Ковалева Зоя Павловна, Тишков Юрий Павлович, Кречетов Юрий Петрович, Шаповалов Юрий Григорьевич, Баженова Людмила Ивановна, Пупков Николай Николаевич, Ардакова Татьяна Георгиевна, Лозина Надежда Леонидовна, Рогозина Надежда Константиновна, Шадрина Надежда Андреевна.

 В начале 80-х пришли в школу выпускники физико-математического факультета Фролова Ирина Валентиновна, Клепикова Нина Ивановна, Левченко Владимир Юрьевич и Светлана Николаевна, а также выпускница историко-филологического факультета – Наталья Павловна Хабарова. И вот уже более тридцати лет они верны Школе №12.

С 1991 по 2001 год школу возглавляет Вера Ивановна Черкезова. Её заместителями были Фигулина Надежда Ивановна, Якимова Тамара Ивановна, Тепанян Галина Елисеевна. В 1994 году в школе созданы классы  программистов, а  2000 году получена лицензия на право ведения педагогической деятельности, целью которой является профессиональная подготовка учащихся по специальностям «Оператор ЭВМ» и «Техник-оператор ЭВМ».  В это время начали свою трудовую деятельность в нашем коллективе Боброва Лиана Евгеньевна и Парченко Татьяна Владимировна, большие профессионалы, мастера своего дела, сумевшие каждый урок сделать событием для учащихся.

С 2001 года руководит школой Наталья Павловна Хабарова. За это время школа №12 дважды стала победителем республиканского конкурса общеобразовательных учреждений, внедряющих инновационные образовательные программы приоритетного национального проекта «Образование» (2008, 2010). Дважды школа №12 была признана «Лучшим образовательным учреждением г. Горно-Алтайска» (2010, 2011 гг)

В 2006 году, в честь 70-летия школы, открыт Музей истории школы №12 г. Горно-Алтайска, который возглавляет Татьяна Николаевна Васильева.

В 2008 году введена в эксплуатацию ещё одна пристройка, в которой располагаются актовый зал на 80 мест и современная мастерская для мальчиков.

Среди выпускников школы немало известных политиков (А.А. Бессмертных, С.В. Кречетов ), ученых (М.А., Л.А., А.А. Певзнер, Ю.А. Лебедев, С. Михайлов, А.М. Апасов,), военных (В.Г. Капустин, В. Зырянов, В.Н. Лазебный, А. Параев),  специалистов в различных отраслях (Е. Лорей (Кручинкина), В. Сорокин, Л. Донских (Шилова), известных спортсменов (В. Маркин, В. Ким, Н. Турова, В. Уланкин, В. Иванов, С. Трофимов, А. Долгов, В. Солодюк, А. Аткунов) .

  Сегодня в школе трудится творческий коллектив, состоящий из 46 педагогов, 19 из которых имеют высшую квалификационную категорию.  За значительные успехи в формировании интеллектуального, культурного и нравственного развития личности школьников Левченко Владимиру Юрьевичу присвоено высокое звание «Заслуженный учитель Российской Федерации», девять педагогов награждены нагрудным знаком «Почетный работник общего образования Российской Федерации».

Более сорока лет отдано школе Баженовой Людмилой Ивановной и Пупковым Николаем Николаевичем.

Долгие годы в школе творчески трудятся замечательные учителя: Смирнова Галина Николаевна, Казакова Антонина Петровна, Кашкарова Надежда Александровна, Бавыкина Ольга Геннадьевна, Тихонова Татьяна Анатольевна, Майжегишева Мария Ивановна, Васильевы Татьяна Николаевна и Николай Леонидович, Секачев Михаил Юрьевич, Иродова Ирина Владимировна.

Традиции школы хранят и приумножают перспективные молодые педагоги: Жанков Сергей Александрович, Титанова Надежда Алексеевна, Чубуков Яков Владимирович, Сорокина Надежда Вячеславовна, Асямова Анастасия Федоровна, Тукпашева Ирина Юрьевна, Левченко Оксана Юрьевна.

История школы продолжается. И страницы школьной летописи заполняют другие ученики и учителя, которые сообща идут по нелегкому пути к высотам истины, мудрости и добра в завтрашний день.